En aquest apartat es presenten el museus en funció de la seva temàtica. Molts d'ells tenen una temàtica molt concreta i clarament definida, però altres disposen de varies seccions i temàtiques diferents, i per tant podrien ésser catalogats com entitats museístiques de caire multitemàtic. Es per aixó que alguns dels museus es poden trobar en més d'un apartat dels trenta en que està dividida aquesta secció.