Darnius ja s’esmenta en un document del s.X com també l’existència de la seva església dedicada a Santa Maria, però que possiblement ja existia molt abans d’aquesta data. El territori que compren avui Darnius havia format part durant anys del comtat de Besalú, que es va formar al s.IX arran de la consolidació de la “Marca hispànica”.
La superfície del municipi és de 34,9 Km2 i a part del propi poble, té en total cinc veïnats (L’Arnera, Barri del Pantà, Ricardell, Veïnat d’Amunt i Veïnat de Mont-Roig).
Dins el municipi de Darnius es troba la reserva hídrica més important de l’Empordà; el Pantà de Boadella, alimentat principalment pel riu La Muga, construït a l'any 1969 i d'una capacitat de 61 Hm3
